Isocitrat-déshydrogénase – wikipedia

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Modèle de bande de l’IDH (NADP +) – Monomères de E. coli Avec isocitrate: magnésium et NADP comme Calottes, selon PDB 1i3 .

Isocitrat-déshydrogénase (IDH) est le nom des enzymes et des complexes enzymes qui catalysent le spin-off oxydatif du dioxyde de carbone à partir de l’isocitrate, avec la création de α-cétoglutarate. Cette réaction fait partie du citratzycle et donc au centre du métabolisme de tous les êtres vivants. La réaction d’inversion, qui ne se produit que dans certains micro-organismes, utilise l’enzyme isocitrat-lyase.

La réaction catalysée:

+ Nad (p) + ⟶ {DisplayStyle LongRightArrow}

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+ CO 2 + Nad (p) h + H +

De l’isocitrate devient CO 2 Formes coupées et kétoglutarates.

Structurellement, l’IDH consiste en alternant les couches α et les feuilles β dans un arrangement sandwich. Il y a deux groupes différents d’enzyme, selon OB NAD + (CE 1.1.1.41 ) Oder NADP + (CE 1.1.1.42 ) Est un cofacteur. Les deux ont MG 2+ ou mn 2+ comme un métal. Les homologues du premier groupe se composent de trois sous-unités (hétérotramer ααβγ) et sont situés dans le mitochondrium, tandis que le deuxième groupe est des homodimères, chacun avec une isoforme dans le mitochondrium et le cytosol. [d’abord] IDH se produit dans tous les êtres vivants. Chez l’homme, les trois isoformes IDH sont codées dans cinq gènes, dont les défauts peuvent conduire à des troubles métaboliques héréditaires:

Extrait de la sous-unité 1: centre catalytique avec Mg 2+ -Ion; Le nid d’acide aminé ASP-283 provient de la sous-unité 2

L’oxydation de l’isocitrate se déroule dans la première étape d’abord En plus du NADH, l’oxalsuccinat d’acide 2-oxocarbonique fournit 2 , qui en tant que ligue à deux dents sur le groupe KET et celle alpha- Groupe carboxy constant le metalion (mn 2+ ou mg 2+ ) complexe. En conséquence, la fonction carbonyle est polarisée, qui est l’inclinaison du bêta Le groupe carboxy constant pour la décarboxylation augmente énormément, de sorte que dans l’étape de décarboxylation suivante, l’énolform du 2-oxoglutarate s’est stabilisé via la formation complexe 3 formes. Après la protonation, le 2-oxoglutarate (α-cétoglutarate) devient 4 libéré. Le nad mitochondrial + -ID-ID-dépendant de l’isocitrate déshydrogénase peut être en contraste avec le NADP + -ID-dépendant ne se lie pas à un oxalsuccinate en tant que substrat pour former du 2-oxoglutarate.

Comme toute déshydrogénase, l’isocitrate déshydrogénase peut être régulée par l’ATP ou l’ADP. L’ATP provoque une inhibition indirecte qui ADP a une activation indirecte de la déshydrogénase car elle affecte la sous-unité kinase. L’ATP stimule la sous-unité du cinéma, qui phosphoryle la sous-unité I de l’isocitrate déshydrogénase, ce qui implique son inactivation. En conséquence, l’ADP agit comme un antagoniste et conduit à une activation indirecte de l’isocitrate déshydrogénase. Ce processus de régulation par phosphorylation et déphosphorylation est décrit comme une version interconvur.

  • P. T. Tan, A. H. Wei: La révolution de l’épigénomique dans la myélodysplasie: une perspective clinico-pathologique. Dans: Pathologie , Bande 43, numéro 6, octobre 2011, S. 536–546, Doi: 10.1097 / pat.0b013e32834a4061 . PMID 21881538 . (Examen).
  • L. Dang, S. Jin, S. M. Su: Mutations IDH dans le gliome et la leucémie myéloïde aiguë. Dans: Tendances en médecine moléculaire , Bande 16, numéro 9, septembre 2010, S. 387–397, Doi: 10.1016 / j.molmed.20.07.007.002 . PMID 20692206 . (Examen).
  • M. Rossetto, P. Cycarin U. un .: Métabolisme des mutations du gliome et IDH1 / IDH2. Dans: Revue neurologique , Band 167, numéro 10, octobre 2011, S. 699–703, doi: 10.1016 / j.neurol.2011.08.002 . PMID 21885076 . (Examen).
  • A. Nekruteko, D. M. Hillis U. suis.: L’isocitrate déshydrogénase cytosolique chez l’homme, les souris et les campagnols et l’analyse phylogénétique de la famille des enzymes. Dans: Biologie et évolution moléculaires , Volume 15, numéro 12, décembre 1998, pp. 1674–1684, PMID 9866202 .
  1. ↑ Interpro: IPR004434 Isocitrate déshydrogénase NAD-dépendante (Anglais)
  2. ↑ 2-hydroxyglutarazidurie . Orphelin
  3. ↑ D. T. Hartong, M. Dange U. un.: Insignes de la rétinite pigmentaire dans les rôles des isocitrates déshydrogénases dans le cycle de Krebs. Dans: Génétique de la nature. Band 40, numéro 10, octobre 2008, S. 1230–1234, Doi: 10.1038 / ng.223 . PMID 18806796 . PMC 2596605 (Texte complet gratuit).