Archaea (klasyfikacja filogenetyczna) – Wikipedia
Artykuł w Wikipedii, Free L’Encyclopéi.
Celem tej strony jest przedstawienie filogenetycznego drzewa Archaea ( Archaebacteria , Archaebacteria, Archaea), to znaczy kladogram podkreślający relacje pokrewieństwa istniejące między ich różnymi grupami (lub taksonami), takie jak proponują je ostatnie uznane analizy. Jest to tylko możliwość, a główne debaty, które pozostają w społeczności naukowej, są krótko przedstawione poniżej, przed bibliografią.
Przedstawiony tutaj kladogram ma być spójny z najnowszymi opublikowanymi i dostępnymi analizami. Niekoniecznie jest to zgodne i zawsze możemy odnosić się do bibliografii wskazanej na dole artykułu.
Symbol ▲ odnosi się do natychmiastowej górnej części żywego drzewa filogenetycznego. Znak ► odnosi się do filogenetycznej klasyfikacji rozważanej grupy. Każdy węzeł drzewa noszący więcej niż dwie gałęzie wykazuje nieokreśloność wewnętrznej filogenezy rozważanej grupy.
Typograficzne nawyki botaników i zoologów są różne. Tutaj, dzięki wygodę czytania i niektórych obecnych grup dotyczących dwóch tradycyjnych obszarów, nazwy taksonów przewyższają gatunek, są napisane właściwymi postaciami, nazwami gatunków lub kursywy.
Po taksonu, jego okres wyglądu, gdy jest znany, można wskazać zgodnie z następującą legendą:
( Dyskusja ): Plejstocen; ( Więcej ): Plioceń; ( Mój ): Mioceń; ( Był ): Oligoceń; ( Dobrze ): Eoceń; ( Kumpel ): Paleocen; ( Glina ): Kredy; ( wokół ): Jurajski; ( Tri Tri ): Trias; ( Za ): Permian; ( Samochód ): Karbonu; ( Diabeł ): Devonian; ( Będzie ): Silluien; ( Słowo ): Ordovician; ( Camb ): Kambryk; ( Był ): Wydawca. Aby uzyskać większą precyzję, jeśli to możliwe, ( – ) : niżej ; ( ~ ) : PRZECIĘTNY ; ( + ) : znakomity.
▲ └ oka Archaebacteria ou archaea ├ oka Thaumarchaeota │ ├ oka Cenarchaeales │ ├ oka nitrozopumilales │ └─? Nitrosocaldales └--O ├--O │ ├ oka Korarchaeota │ └oka Crenarchaeota ou eocyta │ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ │ │ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ │ │ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ │ └ └ │ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ │ └ └ │ ├ Clea? Fervidicoccales │ ├ ├ cidelabales │ │ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ │ │ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ │ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ └ │ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ ├ │ └ └ Clea └ c Erycharchaet ├─? grupy „Arman” ├ oka nanoarchaeota ├─? Nanohaloarchaea └--O ├ oka termokokale └--O ├--O │ ├ oka Metanopyrales │ └oka │ ├ oka Methanobacteriales │ ├ ├ ├o Methanobacteriaceae │ └ └�o metanothermaceae │ └ oka metanokokale │ ├ oka Methanococcaceae │ └ oka Methanocaldococcaceae └--O ├ oka termoplazmatales ou pikrofilales │ ├ oka termoplasmataceae │ └oka │ ├ oka Picrofilaceae │ └─o ferroplasmataceae └--O ├ oka Archaeoglobales └--O ├ oka Halobacteriales └ oka Metanomicrobia ├ oka Metanosarcinales │ ├ oka Methanosarcinaceae │ ├ oka Methanosaetaceae │ └ oka Metermicoccaceae ├ oka Methanocelles └ oka Metanomicrobiales ├ oka Methanospirillaceae ├ oka Methanocorpusculaceae └ oka Methanomicrobiaceae
Debata naukowa dotycząca filogenezy archaei [[[ modyfikator |. Modyfikator i kod ]
Jeśli dzisiaj, pomimo dużej odległości oddzielającej dwa główne podziały archaiczne, wydaje się, że monofylie grupy (wbrew zakorzeniu eukariotów w eocytach), kontrowersyjne pytanie dotyczy pochodzenia bakterii metanogennych: charakter pojawił się tylko raz późno ( por . Gao i Gupta) lub tylko raz u podstawy Euryarch (i zagubionych w niektórych grupach) lub kilkakrotnie. Odkrycie nowej archaei, które prawdopodobnie rozbiegł się u podstawy drzewa, lub „kwasofilne nanororystyki Archéeny kopalni Richmond” (zwane Armanem), umożliwia lepsze spojrzenie na różnorodność grupy, w oczekiwaniu na satysfakcjonujący widok jej filogenezy .
Klasyfikacja Selon Cavalier-Smith [[[ modyfikator |. Modyfikator i kod ]
Klasyfikacja według Bergey’s [[[ modyfikator |. Modyfikator i kod ]
Klasyfikacja według Gao i Gupta [[[ modyfikator |. Modyfikator i kod ]
Drzewo to ustalono zgodnie z obecnością niektórych specyficznych białek w różnych grupach.
Klasyfikacja według GAO i Gupta 2007
: Dokument używany jako źródło do napisania tego artykułu.
Odniesienie źródeł bibliograficznych [[[ modyfikator |. Modyfikator i kod ]
- Miklós csűrös et istván miklós: «Upływający i duże genomy przodków w archaei wywnioskowane z filogenetycznym modelem urodzenia i śmierci» W Mol. Biol. Evol. , tom. 26, nr 9, 2009, s. 2087-2095
- Simonetta Gribaldo, Patrick Forterre i Céline Brochier-armanet: „ Archaea: Ewolucja i różnorodność trzeciego obszaru życia », Byk. Soc. Ks. Mikrobiol. , tom. 23, nr 3, 2008, s. 137–145
- Beile Gao et Radhey S Gupta: «Analiza filogenomiczna białek, które są charakterystyczne archaea i jej głównych podgrup oraz pochodzenie metanogenezy» W BMC Genomics , 8:86, 2007
- George M. Garrity, Timothy G. Lilburn, James R. Cole, Scott H. Harrison, Jean Euzéby i Brian J. Tindall: Zarys taksonomiczny bakterii i archaea (Toba). Wydanie 7.7 , 2007, «Część 1 – Archaea: Phyla crenarchaeota i Euryarchaeota», s. 6-31
- Brett J. Baker, Gene W. Tyson, Richard I. Webb, Judith Flanagan, Philip Hugenholtz, Eric E. Allen i Jillian F. Banfield: «Linie kwasofilicznej archaea ujawnione przez społeczną analizę genomową» W Nauka , tom. 314, s. 1933-1935, 2006
- Simonetta Gribaldo i Céline Brochier-Armanet: «Pochodzenie i ewolucja Archaea: A State of the Art» W Phil. Trans. R. Soc. B , tom. 361, pp. 1007–1022, 2006
- Céline Brochier, Patrick Forterre i Simonetta Gibaldo: «Pojawiający się filogenetyczny rdzeń archaea: filogenezy maszyn do transkrypcji i translacji zbiegają się po dodaniu nowych sekwencji genomu» W BMC Evolutionary Biology , 2005, 5:36
- George M. Garrity, Julia A. Bell et Timothy G. Lilburn: Zarys taksonomiczny prokariotów, wydanie 5.0 – Manuel Bergey’s Systematic Bacteriology, drugie wydanie , 2004, s. 1-399
- Thomas Cavalier-Smith: «Neomuran pochodzenia archebacterii, negibacterial korzeń uniwersalnego drzewa i megaklasyfikacja bakteryjna» W International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology , tom. 52, pp. 7–76, 2002
Inne źródła bibliograficzne [[[ modyfikator |. Modyfikator i kod ]
Źródła Internet [[[ modyfikator |. Modyfikator i kod ]
Powiązane artykuły [[[ modyfikator |. Modyfikator i kod ]
Recent Comments