Micx SRNA – Wikipedia wiki

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Micx Deer (anciennement connu sous le nom A10 ) [d’abord] est un petit ARN non codant trouvé dans Vibrio cholerae . [2] Il a reçu le nom Micx car il a une fonction similaire à Mica, Micc et MICF dans E. coli . [3] Micx SRNA régule négativement une protéine de membrane externe (codée pour par VC0972 ) Et aussi un composant d’un transporteur ABC (gène VC0620 ). [4] Ces interactions ont été prédites puis confirmées à l’aide d’un microréseau ADN. [2]

Micx a été identifié via un écran bioinformatique de V. Cholerae ayant été prédit auparavant. [d’abord] Les niveaux de transcription de cet ARNs ont été comparés dans plusieurs conditions: il s’est avéré exprimé sur tous les supports testés; des médiums plus riches ont légèrement réduit la transcription; répression de certains facteurs sigma (δ S et Δ ET ) n’a pas changé de transcription mais il a été considérablement réduit en l’absence de protéine HFQ. [2] Cette observation est conforme aux autres modèles d’expression de l’ARNs. [5] [6]

Le gène Micx ARN chevauche avec VCA0943 – Un gène codant pour une perméase du transporteur de maltose – mais la ribonucléase ARNase E traite le transcrit Micx pour créer une forme active et stable contenant uniquement le VCA0943 3 ‘UTR. [2]

Voir également [ modifier ]]

Les références [ modifier ]]

  1. ^ un b Livny J, Fogel MA, Davis BM, Waldor MK (2005). “Srnapredict: une approche de calcul intégative pour identifier les ARNs dans les génomes bactériens” . Recherche des acides nucléiques . 33 (13): 4096–4105. est ce que je: 10.1093 / nar / gki715 . PMC 1180744 . PMID 16049021 .
  2. ^ un b c d Davis BM, Waldor MK (juillet 2007). “Le traitement dépendant de RNase E stabilise Micx, un SRNA de Vibrio cholerae” . Microbiologie moléculaire . 65 (2): 373–385. est ce que je: 10.1111 / j.1365-2958.2007.05796.x . PMC 1976385 . PMID 17590231 .
  3. ^ Mizuno T, Chou My, Inouye M (avril 1984). “Un mécanisme unique régulant l’expression des gènes: inhibition de la translation par un transcrit d’ARN complémentaire (micrA)” . Actes de l’Académie nationale des sciences des États-Unis d’Amérique . 81 (7): 1966–1970. Bibcode: 1984pnas … 81.1966m . est ce que je: 10.1073 / pnas.81.7.1966 . PMC 345417 . PMID 6201848 .
  4. ^ La chanson, Akarit, Nordd et Night, Au Ruz, Buil, Jamila, Jolas, Vécaka, Valolas 2088). “Un nouveau vibrio cholerae sRNA module la colonisation et affecte la libération de vésicules de membrane externe” . Microbiologie moléculaire . 70 (1): 100–111. est ce que je: 10.1111 / j.1365-2958.2008.06392.x . PMC 2628432 . PMID 18681937 .
  5. ^ Sledjeski DD, Whitman C, Zhang A (mars 2001). “HFQ est nécessaire pour la régulation par le DSRA ARN non traduit” . Journal of Bactériologie . 183 (6): 1997-2005. est ce que je: 10.1128 / jb.183.6.1997-2005.2001 . PMC 95095 . PMID 11222598 .
  6. ^ Masté E, Escorcia FE, Gottesman S (octobre 2003). “Dégradation couplée d’un petit ARN régulatrice et de ses cibles d’ARNm dans Escherichia coli” . Gènes et développement . 17 (19): 2374–2383. est ce que je: 10.1101 / gad.1127103 . PMC 218075 . PMID 12975324 .

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