Micx SRNA – Wikipedia wiki
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Micx Deer (anciennement connu sous le nom A10 ) [d’abord] est un petit ARN non codant trouvé dans Vibrio cholerae . [2] Il a reçu le nom Micx car il a une fonction similaire à Mica, Micc et MICF dans E. coli . [3] Micx SRNA régule négativement une protéine de membrane externe (codée pour par VC0972 ) Et aussi un composant d’un transporteur ABC (gène VC0620 ). [4] Ces interactions ont été prédites puis confirmées à l’aide d’un microréseau ADN. [2]
Micx a été identifié via un écran bioinformatique de V. Cholerae ayant été prédit auparavant. [d’abord] Les niveaux de transcription de cet ARNs ont été comparés dans plusieurs conditions: il s’est avéré exprimé sur tous les supports testés; des médiums plus riches ont légèrement réduit la transcription; répression de certains facteurs sigma (δ S et Δ ET ) n’a pas changé de transcription mais il a été considérablement réduit en l’absence de protéine HFQ. [2] Cette observation est conforme aux autres modèles d’expression de l’ARNs. [5] [6]
Le gène Micx ARN chevauche avec VCA0943 – Un gène codant pour une perméase du transporteur de maltose – mais la ribonucléase ARNase E traite le transcrit Micx pour créer une forme active et stable contenant uniquement le VCA0943 3 ‘UTR. [2]
Voir également [ modifier ]]
Les références [ modifier ]]
- ^ un b Livny J, Fogel MA, Davis BM, Waldor MK (2005). “Srnapredict: une approche de calcul intégative pour identifier les ARNs dans les génomes bactériens” . Recherche des acides nucléiques . 33 (13): 4096–4105. est ce que je: 10.1093 / nar / gki715 . PMC 1180744 . PMID 16049021 .
- ^ un b c d Davis BM, Waldor MK (juillet 2007). “Le traitement dépendant de RNase E stabilise Micx, un SRNA de Vibrio cholerae” . Microbiologie moléculaire . 65 (2): 373–385. est ce que je: 10.1111 / j.1365-2958.2007.05796.x . PMC 1976385 . PMID 17590231 .
- ^ Mizuno T, Chou My, Inouye M (avril 1984). “Un mécanisme unique régulant l’expression des gènes: inhibition de la translation par un transcrit d’ARN complémentaire (micrA)” . Actes de l’Académie nationale des sciences des États-Unis d’Amérique . 81 (7): 1966–1970. Bibcode: 1984pnas … 81.1966m . est ce que je: 10.1073 / pnas.81.7.1966 . PMC 345417 . PMID 6201848 .
- ^ La chanson, Akarit, Nordd et Night, Au Ruz, Buil, Jamila, Jolas, Vécaka, Valolas 2088). “Un nouveau vibrio cholerae sRNA module la colonisation et affecte la libération de vésicules de membrane externe” . Microbiologie moléculaire . 70 (1): 100–111. est ce que je: 10.1111 / j.1365-2958.2008.06392.x . PMC 2628432 . PMID 18681937 .
- ^ Sledjeski DD, Whitman C, Zhang A (mars 2001). “HFQ est nécessaire pour la régulation par le DSRA ARN non traduit” . Journal of Bactériologie . 183 (6): 1997-2005. est ce que je: 10.1128 / jb.183.6.1997-2005.2001 . PMC 95095 . PMID 11222598 .
- ^ Masté E, Escorcia FE, Gottesman S (octobre 2003). “Dégradation couplée d’un petit ARN régulatrice et de ses cibles d’ARNm dans Escherichia coli” . Gènes et développement . 17 (19): 2374–2383. est ce que je: 10.1101 / gad.1127103 . PMC 218075 . PMID 12975324 .
Dès la lecture [ modifier ]]
- Gottesman S (2004). “Les petits régulateurs d’ARN d’Escherichia coli: rôles et mécanismes *” . Revue annuelle de la microbiologie . 58 : 303–328. est ce que je: 10.1146 / annurev.micro.58.030603.123841 . PMID 15487940 .
- Schlüter JP, Reinkensmeier J, Daschkey S, Evguena-Hackenberg E, Janssen S, Jänicke S, Becker JD, Giegerich R, Becker A (avril 2010). “Une étude à l’échelle du génome des ARNs dans l’alpha-protéobacterium Sinorhizobium Meliloti à la fixation de l’azote” . BMC Genomics . 11 : 245. doi: 10.1186 / 1471-2164-11-245 . PMC 2873474 . PMID 20398411 .
- Sittka A, Sharma CM, Rolle K, Vogel J (juillet 2009). “Le séquençage profond de l’ARN de Salmonella associé aux protéines HFQ hétérologues in vivo révèle les petits ARN comme une classe cible majeure et identifie les phénotypes de traitement de l’ARN” . Biologie de l’ARN . 6 (3): 266-275. est ce que je: 10.4161 / RNA.6.3.8332 . PMID 19333007 .
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