Récepteurs de type rhodopsine – Wikipedia wiki

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Famille de protéines

Récepteurs de type rhodopsine sont une famille de protéines qui composent le plus grand groupe de récepteurs couplés aux protéines G. [2]

Les récepteurs couplés aux protéines G, GPCR, constituent une vaste famille de protéines qui englobe un large éventail de fonctions (y compris divers processus autocrines, paracrines et endocriniens). Ils montrent une diversité considérable au niveau de la séquence, sur la base desquels ils peuvent être séparés en groupes distincts. Les GPCR sont généralement décrits comme «superfamiliaux» car ils embrassent un groupe de familles pour lesquelles il existe des indications de relation évolutive, mais entre lesquelles il n’y a pas de similitude statistiquement significative dans la séquence. [2] Les membres de la superfamille actuellement connus incluent les GPCR de type rhodopsine (cette famille), les GPCR de type sécrétine, les récepteurs du camp, les récepteurs fongiques de phéromones d’accouplement et la famille des récepteurs métabotropes du glutamate. Il existe une base de données spécialisée pour les GPCR. [3]

Fonction [ modifier ]]

Les GPCR de type rhodopsine elles-mêmes représentent une famille de protéines répandue qui comprend l’hormone, le neuropeptide, le neurotransmetteur et les récepteurs légers, qui transduisent tous des signaux extracellulaires par interaction avec les protéines de liaison aux nucléotides de guanine (G). Bien que leurs ligands activants varient considérablement en structure et en caractère, les séquences d’acides aminés des récepteurs sont très similaires et sont censées adopter un cadre structurel commun comprenant 7 hélices transmembranaires (TM). [4] [5] [6]

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Des classes [ modifier ]]

Les GPCR de type rhodopsine ont été classés dans les 19 sous-groupes suivants (A1-A19) sur la base d’une analyse phylogénétique. [7]

Sous-famille A1 [ modifier ]]

Sous-famille A2 [ modifier ]]

Sous-famille A3 [ modifier ]]

Sous-famille A4 [ modifier ]]

Sous-famille A5 [ modifier ]]

Sous-famille A6 [ modifier ]]

Sous-famille A7 [ modifier ]]

Sous-famille A8 [ modifier ]]

Sous-famille A9 [ modifier ]]

Sous-famille A10 [ modifier ]]

Sous-famille A11 [ modifier ]]

Sous-famille A12 [ modifier ]]

Sous-famille A13 [ modifier ]]

Sous-famille A14 [ modifier ]]

Sous-famille A15 [ modifier ]]

Sous-famille A16 [ modifier ]]

  • Opsins Interpro: IPR001760 [8]
    • Rhodopsine ( Rho , OPSD)
    • Opsine 1 (pigments de cône), sensible aux ondes courtes (aveuglement couleur, tritan) ( OPN1SW , OPSB) (opsin bleu-sensible)
    • Opsine 1 (pigments de cône), sensible aux ondes moyennes (aveuglement couleur, deutan) ( UPN1MW , OPSG) (Opsine sensible au vert)
    • Opsine 1 (pigments de cône), sensible aux ondes longues (aveuglement couleur, protan) ( Upn1lw , OPSR) (Opsin sensible au rouge)
    • Ops 3, Panops ( OPN3 )
    • Ops 4, Melanops ( Casquette )
    • Opsin 5 ( OPN5 , GPR136)
    • Récepteur couplé à la protéine G rétinienne ( RGR )
    • Homologue de la rhodopsine dérivée de l’épithélium du pigment rétinien ( RRH , OPSX) (récepteur visuel en forme de pigment opsin) Interpro: IPR001793

Sous-famille A17 [ modifier ]]

Sous-famille A18 [ modifier ]]

Sous-famille A19 [ modifier ]]

Non classé [ modifier ]]

Les références [ modifier ]]

  1. ^ Palczewski K, Kumasaka T, Hori T, et al. (Août 2000). “Structure cristalline de la rhodopsine: un récepteur couplé à la protéine G”. Science . 289 (5480): 739–45. Bibcode: 2000Sci … 289..739p . est ce que je: 10.1126 / science.289.5480.739 . PMID 10926528 .
  2. ^ un b Attwood TK, Findlay JB (1994). “Recepteurs couplés à l’empreinte digitale”. Protéine A . 7 (2): 195-203. est ce que je: 10.1093 / protéine / 7.2.195 . PMID 8170923 .
  3. ^ “Système d’information pour les récepteurs couplés aux protéines G” . Gpcrdb . www.gpcr.org. Archivé de l’original le 2009-04-22 . Récupéré 2008-12-05 .
  4. ^ Birnbaumer L (1990). “Pro protéines dans la transduction du signal”. Annu. Rev. Pharmacol. Toxique . 30 : 675–705. est ce que je: 10.1146 / annurev.pa.30.040190.003331 . PMID 2111655 .
  5. ^ Gilman AG, Casey PJ (1988). “L’implication des protéines G dans le couplage récepteur-effecteur”. J. Biol. Chem . 263 (6): 2577–2580. PMID 2830256 .
  6. ^ Attwood TK, Findlay JB (1993). “Conception d’une empreinte digitale discriminante pour les récepteurs couplés aux protéines G”. Protéine A . 6 (2): 167–176. est ce que je: 10.1093 / protéine / 6.2.167 . PMID 8386361 .
  7. ^ Joost P, Methner A (2002). “Analyse phylogénétique de 277 récepteurs couplés à la protéine G humain comme outil pour la prédiction des ligands des récepteurs orphelins” . Génome biol . 3 (11): Research0063.1–0063.16. est ce que je: 10.1186 / gb-2002-3-11-research0063 . PMC 133447 . PMID 12429062 .
  8. ^ Terakita A (2005). “Les opsins” . Génome biol . 6 (3): 213. doi: 10.1186 / gb-2005-6-3-213 . PMC 1088937 . PMID 15774036 .
  9. ^ un b Nordström KJ, Sällman Almén M, Edstam MM, Fredriksson R, Schiöth HB (septembre 2011). “Les analyses indépendantes de HHSEARCH, d’aiguille – basée sur les wunsch révèlent la hiérarchie globale de la plupart des familles de récepteurs couplés aux protéines G” . Biologie et évolution moléculaires . 28 (9): 2471–80. est ce que je: 10.1093 / molbev / msr061 . PMID 21402729 .

Liens externes [ modifier ]]

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