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Base de données taxonomique pour les oiseaux

Avibase est une base de données taxonomique en ligne qui organise les données taxonomiques et de distribution des oiseaux à l’échelle mondiale. À la base, la base de données repose sur la notion de concepts taxonomiques. [ Clarification nécessaire ]] [d’abord] [2] plutôt que les noms taxonomiques [3] (voir également [4] [5] [6] pour la raison d’être de l’utilisation de concepts taxonomiques). Avibase intègre et organise des données taxonomiques des principaux éditeurs taxonomiques aviaires ( La liste de contrôle Clements des oiseaux du monde , [7] Manuel des oiseaux du monde , Birdlife International, [8] Liste de contrôle IOC [9] et le Liste de contrôle complète de Howard et Moore des oiseaux du monde [dix] ) et d’autres sources régionales (par exemple toutes les éditions de la Liste de contrôle de l’American Ornithological Society des oiseaux nord-américains depuis 1886). Des concepts taxonomiques dans plus de 230 sources taxonomiques différentes ont été cartographiés et référencés croisés aux concepts Avibase.

Le site Web propose également des listes de contrôle pour plus de 20 000 régions géographiques du monde, des pages d’espèces avec des informations taxonomiques et des synonymes, et des outils pour les observateurs pour maintenir leurs propres observations et obtenir des rapports (par exemple, MAP montrant des pays ou des points chauds EBIRD avec le nombre d’espèces cibles qui ciblent qui ciblent les espèces cibles qui cibles qui ont été sont manquants dans une de leur liste de vie).

Histoire et but [ modifier ]]

Avibase a été créée et est maintenue par Denis LePage, directeur principal de la science des données et de la technologie chez Birds Canada. Les données contenues dans Avibase ont été recueillies à partir de 1991. [11] Le site Web d’Avibase a été lancé en juin 2003 et est organisé par Birds Canada (anciennement Bird Studies Canada) depuis sa création.

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Caractéristiques [ modifier ]]

Concepts taxonomiques . La base de données est organisée principalement autour d’un tableau de concepts taxonomiques uniques. Chaque concept représente une circonscription biologique unique et a reçu un ID alphanumérique unique appelé ID Avibase. Les ID Avibase permettent le suivi des concepts taxonomiques congruents entre les sources de publication. Il y a environ 58 000 concepts taxonomiques uniques décrits dans Avibase. Il s’agit notamment des concepts traditionnellement reconnus comme des espèces et des sous-espèces, mais aussi d’autres groupes taxonomiques (groupes de sous-espèces), divers traitements taxonomiques alternatifs reconnus historiquement, et d’autres concepts représentant des hybrides, des morphes de couleurs et des formes invalides ou douteuses.

Données de nomenclature . Chaque nom scientifique est également décrit pour inclure des données de citation et le nom associé à la description originale. Environ 48 000 actes [ Clarification nécessaire ]] ont été enregistrés dans Avibase et divers types de synonymes sont également disponibles.

Listes de contrôle des espèces régionales sont disponibles pour plus de 20 000 régions du monde. Cela comprend tous les pays, territoires et dépendances, et la plupart des régions définies dans les couches infranationales GADM telles que les provinces, les États, les préfectures, les comtés, les départements, les municipalités et les districts (niveaux GADM 1 et 2), ainsi que plus de 2500 îles. Les listes de contrôle régionales sont disponibles dans plusieurs formats taxonomiques et peuvent également intégrer des noms communs dans une variété de langues. Les données pour les listes de contrôle régionales proviennent d’un grand nombre de sources, telles que l’ensemble de données EBID EBD et des forums tels que Facebook Global Rare Bird Alert.

Noms et synonymes communs sont disponibles dans 271 langues et variantes régionales différentes, et il y a 21 langues qui ont une couverture supérieure à 85% des espèces avec un nom commun connu.

Mysavable , lancé en 2013, fournit des outils gratuits aux utilisateurs qui souhaitent maintenir leurs listes de vie et générer des rapports axés sur la recherche d’espèces cibles que l’observateur n’a pas encore vu (où aller, quoi voir, quand aller, combien de temps Visite), ou statistiques régionales générales (par exemple, nombre total d’espèces par pays).

  1. ^ “Le concept de” taxons potentiels “dans les bases de données.” Berendsohn WG (1995) Taxon 44: 207–212.
  2. ^ “Représentation du modèle de données standard pour les informations taxonomiques.” Kennedy J, Hyam R, Kukla R, Paterson T (2006). Omics: A Journal of Integrative Biology 10: 220–230.
  3. ^ “Avibase – un système de base de données pour gérer et organiser des concepts taxonomiques.” , Lepage, Denis, Gaurav Vaidya et Robert Guralnick, Zookeys , 420 (25 juin 2014): 117–35.
  4. ^ “Taxonomie pour les humains ou les ordinateurs? Pragmatiques cognitives pour les mégadonnées.” Sterner, Beckett et Nico M. Franz. 2017. Théorie biologique 12 (2): 99–111.
  5. ^ Pour augmenter la confiance, modifiez la conception sociale derrière les données agrégées de la biodiversité. Franz, Nico M. et Beckett W. Sterner. 2018. Base de données 2018 (janvier).
  6. ^ “Contrôle de la variable taxonomique: résolution de concept taxonomique pour un portail d’herbier du sud-est des États-Unis.” Franz, Nico, Edward Gilbert, Bertram Ludäscher et Alan Waiwley. 2016. Idées de recherche et résultats 2 (septembre): E10610.
  7. ^ Liste de contrôle Ebird / Clements des oiseaux du monde: V2019 Clements, J. F., T. S. Schulenberg, M. J. Iliff, S. M. Billerman, T. A. Fredericks, B. L. Sullivan et C. L. Wood. 2019.
  8. ^ Handbook of the Birds of the World and BirdLife International Digital Liste des oiseaux du monde. Version 4. HBW et BirdLife International (décembre 2019)
  9. ^ Liste des oiseaux du monde IOC (V10.1) Gill F, D Donsker & P Rasmussen (Eds). 2020.
  10. ^ La liste de contrôle complète de Howard et Moore des oiseaux du monde, version 4.1 (liste de contrôle téléchargeable) Archivé 2020-06-03 à la machine Wayback Christidis et al. 2018.
  11. ^ “Avibase – The World Bird Database” . avibase.bsc-yoc.org .

Les références [ modifier ]]

  • Vaidya, Gaurav; Lepage, Denis; Gulralnick, Robert (2018), “Le tempo et le mode du processus de correction taxonomique: comment les taxonomistes ont corrigé et récupéré les espèces d’oiseaux nord-américaines au cours des 127 dernières années”, Plos un , 13 (4): E0195736, Bibcode: 2018ploso..1395736v , est ce que je: 10.1371 / journal.pone.0195736 , PMC 5909608 , PMID 29672539

Liens externes [ modifier ]]

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