[{"@context":"http:\/\/schema.org\/","@type":"BlogPosting","@id":"https:\/\/wiki.edu.vn\/en2fr\/wiki28\/initiative-de-biologie-des-systemes-de-la-nouvelle-galles-du-sud\/#BlogPosting","mainEntityOfPage":"https:\/\/wiki.edu.vn\/en2fr\/wiki28\/initiative-de-biologie-des-systemes-de-la-nouvelle-galles-du-sud\/","headline":"Initiative de biologie des syst\u00e8mes de la Nouvelle-Galles du Sud wiki","name":"Initiative de biologie des syst\u00e8mes de la Nouvelle-Galles du Sud wiki","description":"before-content-x4 Un article de Wikip\u00e9dia, l’encyclop\u00e9die libre after-content-x4 Le Initiative de biologie des syst\u00e8mes de la Nouvelle-Galles du Sud ,","datePublished":"2020-04-26","dateModified":"2020-04-26","author":{"@type":"Person","@id":"https:\/\/wiki.edu.vn\/en2fr\/wiki28\/author\/lordneo\/#Person","name":"lordneo","url":"https:\/\/wiki.edu.vn\/en2fr\/wiki28\/author\/lordneo\/","image":{"@type":"ImageObject","@id":"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/c9645c498c9701c88b89b8537773dd7c?s=96&d=mm&r=g","url":"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/c9645c498c9701c88b89b8537773dd7c?s=96&d=mm&r=g","height":96,"width":96}},"publisher":{"@type":"Organization","name":"Enzyklop\u00e4die","logo":{"@type":"ImageObject","@id":"https:\/\/wiki.edu.vn\/wiki4\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/download.jpg","url":"https:\/\/wiki.edu.vn\/wiki4\/wp-content\/uploads\/2023\/08\/download.jpg","width":600,"height":60}},"image":{"@type":"ImageObject","@id":"https:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Special:CentralAutoLogin\/start?type=1x1","url":"https:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Special:CentralAutoLogin\/start?type=1x1","height":"1","width":"1"},"url":"https:\/\/wiki.edu.vn\/en2fr\/wiki28\/initiative-de-biologie-des-systemes-de-la-nouvelle-galles-du-sud\/","wordCount":2695,"articleBody":"     (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});before-content-x4Un article de Wikip\u00e9dia, l’encyclop\u00e9die libre        (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});after-content-x4Le Initiative de biologie des syst\u00e8mes de la Nouvelle-Galles du Sud , r\u00e9alis\u00e9 par Marc Wilkins est une installation \u00e0 but non lucratif au sein de l’\u00e9cole de biotechnologie et de sciences biomol\u00e9culaires de l’Universit\u00e9 de la Nouvelle-Galles du Sud. Leur objectif est de g\u00e9rer des recherches fondamentales et appliqu\u00e9es dans le d\u00e9veloppement et l’application de la bioinformatique pour la g\u00e9nomique et la prot\u00e9omique.         (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});after-content-x4Table of ContentsRecherche men\u00e9e \u00e0 l’initiative de biologie des syst\u00e8mes [ modifier ]] M\u00e9thylation sur le prot\u00e9ome de Saccharomyces cerevisiae [ modifier ]] S\u00e9paration et identification des complexes prot\u00e9iques [ modifier ]] Visualiser les prot\u00e9ines, les complexes et les r\u00e9seaux d’interaction [ modifier ]] Les r\u00e9f\u00e9rences [ modifier ]] Liens externes [ modifier ]] Recherche men\u00e9e \u00e0 l’initiative de biologie des syst\u00e8mes [ modifier ]] Les chercheurs de l’\u00e9tablissement travaillent actuellement sur les projets suivants: [ citation requise ]] M\u00e9thylation sur le prot\u00e9ome de Saccharomyces cerevisiae [ modifier ]] Les modifications g\u00e9n\u00e8rent des effets conditionnels sur les prot\u00e9ines, selon lesquelles leur attachement covalent aux acides amin\u00e9s entra\u00eenera la perturbation d’une prot\u00e9ine particuli\u00e8re entra\u00eenant un impact sur les interactions potentielles de sa forme nouvellement modifi\u00e9e. [d’abord] La m\u00e9thylation est l’une des modifications post-traductionnelles les plus reconnues dans les histones pour la structure de la chromatine et l’expression des g\u00e8nes. [2] C’est \u00e9galement l’une des nombreuses modifications trouv\u00e9es sur les courtes r\u00e9gions N-terminales des histones, qui s’assemblent pour former le code des histones, qui r\u00e9gule l’assemblage de la chromatine et la r\u00e9gulation des g\u00e8nes \u00e9pig\u00e9n\u00e9tiques. [3] L’identification de la m\u00e9thylation \u00e0 travers l’interactome est mal document\u00e9e. Des chercheurs de la System Biology Initiative ont identifi\u00e9 des techniques pour identifier de nouveaux r\u00e9sidus de lysine et d’arginine m\u00e9thyl\u00e9s via la spectrom\u00e9trie de masse [4] et les empreintes digitales de masse peptidique. [5] Actuellement, les chercheurs sont en train d’utiliser ces techniques pour identifier de nouveaux r\u00e9sidus m\u00e9thyl\u00e9s dans le Saccharomyces cerevisiae interactome. S\u00e9paration et identification des complexes prot\u00e9iques [ modifier ]] Une analyse \u00e0 grande \u00e9chelle des complexes prot\u00e9iques est une difficult\u00e9 \u00e9mergente en tant que m\u00e9thodes de fractionnement des complexes prot\u00e9iques qui ne sont pas compatibles avec les techniques prot\u00e9omiques en aval. L’initiative de biologie des syst\u00e8mes utilise la technique de l’\u00e9lectrophor\u00e8se d’\u00e9lution continue native (BN-CEE). [6] Cette m\u00e9thode g\u00e9n\u00e8re des fractions en phase liquide des complexes prot\u00e9iques. Les complexes r\u00e9sultants peuvent \u00eatre analys\u00e9s davantage par \u00e9lectrophor\u00e8se sur gel de polyacrylamide et spectrom\u00e9trie de masse. Cela aidera \u00e0 identifier les prot\u00e9ines constituantes de nombreux complexes. Actuellement, les chercheurs utilisent cette technique sur le Saccharomyces cerevisiae lysat cellulaire.        (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});after-content-x4Visualiser les prot\u00e9ines, les complexes et les r\u00e9seaux d’interaction [ modifier ]] L’int\u00e9gration des donn\u00e9es biologiques, y compris les structures prot\u00e9iques, les interactions, etc. peut \u00eatre g\u00e9n\u00e9r\u00e9e par la technologie automatis\u00e9e. L’importance de ces donn\u00e9es peut souvent \u00eatre perdue sans visualisation appropri\u00e9e des donn\u00e9es. L’Initiative de biologie des syst\u00e8mes travaille actuellement sur une adaptation du syst\u00e8me de visualisation Skyrails. Ce syst\u00e8me, appel\u00e9 l’interactonium, utilise une cellule virtuelle pour la visualisation du r\u00e9seau d’interaction, des complexes prot\u00e9iques et des structures prot\u00e9iques 3-D de Saccharomyces cerevisiae . [7] L’outil peut afficher des r\u00e9seaux complexes de jusqu’\u00e0 40 000 prot\u00e9ines ou 6000 complexes multiprot\u00e9ines. L’interactorium permet une vision \u00e0 plusieurs niveaux de la biologie mol\u00e9culaire de la cellule. L’interactorium est disponible en t\u00e9l\u00e9chargement. [8] Les r\u00e9f\u00e9rences [ modifier ]] ^  Wilkins MR, Kummerfeld SK (mai 2008). “Rester ensemble? S’effondrer? Explorer la dynamique de l’interactome”. Tendances des sciences biochimiques . 33 (5): 195\u2013200. est ce que je: 10.1016 \/ j.tibs.2008.03.001 . PMID 18424047 .  ^  Fischle W, Tseng BS, Dormann HL, et al. (D\u00e9cembre 2005). “R\u00e9gulation de la liaison HP1-chromatine par la m\u00e9thylation et la phosphorylation de l’histone H3”. Nature . 438 (7071): 1116\u201322. Bibcode: 2005natur.438.1116f . est ce que je: 10.1038 \/ nature04219 . PMID 16222246 . S2cid 4401960 .  ^  Strahl BD, Allis CD (janvier 2000). “La langue des modifications covalentes des histones”. Nature . 403 (6765): 41\u20135. Bibcode: 2000natur.403 … 41S . est ce que je: 10.1038 \/ 47412 . PMID 10638745 . S2cid 4418993 .  ^  Couttas TA, Raftery MJ, Bernardini G, Wilkins MR (juillet 2008). “Scanning d’ions d’immonium pour la d\u00e9couverte des modifications post-traductionnelles et son application aux histones”. Journal of Proteome Research . 7 (7): 2632\u201341. est ce que je: 10.1021 \/ pr700644t . PMID 18517236 .  ^  Pang CN, Galeiger E, Wilkins MR (2010). “Identification de l’arginine et de la lysine-m\u00e9thylation dans le prot\u00e9ome de Saccharomyces cerevisiae et ses implications fonctionnelles” . BMC Genomics . 11 : 92. doi: 10.1186 \/ 1471-2164-11-92 . PMC 2830191 . PMID 20137074 .  ^  Huang KY, Filarsky M, Padula MP, Raftery MJ, Herbert BR, Wilkins MR (mai 2009). “Fractionnement micropr\u00e9paratif du complexe par \u00e9lectrophor\u00e8se d’\u00e9lution continue native native”. Prot\u00e9omique . 9 (9): 2494\u2013502. est ce que je: 10.1002 \/ pMc.200800525 . PMID 19343713 . S2cid 22256093 .  ^  Widjaja YY, Pang CN, Li SS, Wilkins MR, Lambert TD (d\u00e9cembre 2009). “L’interactorium: visualiser les prot\u00e9ines, les complexes et les r\u00e9seaux d’interaction dans une cellule 3D virtuelle”. Prot\u00e9omique . 9 (23): 5309\u201315. est ce que je: 10.1002 \/ pMc.200900260 . PMID 19798670 . S2cid 42891761 .  ^  “T\u00e9l\u00e9chargements: l’interactorium” . Initiative de biologie des syst\u00e8mes de la Nouvelle-Galles du Sud.  Liens externes [ modifier ]]        (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});after-content-x4"},{"@context":"http:\/\/schema.org\/","@type":"BreadcrumbList","itemListElement":[{"@type":"ListItem","position":1,"item":{"@id":"https:\/\/wiki.edu.vn\/en2fr\/wiki28\/#breadcrumbitem","name":"Enzyklop\u00e4die"}},{"@type":"ListItem","position":2,"item":{"@id":"https:\/\/wiki.edu.vn\/en2fr\/wiki28\/initiative-de-biologie-des-systemes-de-la-nouvelle-galles-du-sud\/#breadcrumbitem","name":"Initiative de biologie des syst\u00e8mes de la Nouvelle-Galles du Sud wiki"}}]}]