[{"@context":"http:\/\/schema.org\/","@type":"BlogPosting","@id":"https:\/\/wiki.edu.vn\/wiki19\/2021\/01\/26\/workflow-management-system-fur-bioinformatik-wikipedia\/#BlogPosting","mainEntityOfPage":"https:\/\/wiki.edu.vn\/wiki19\/2021\/01\/26\/workflow-management-system-fur-bioinformatik-wikipedia\/","headline":"Workflow-Management-System f\u00fcr Bioinformatik – Wikipedia","name":"Workflow-Management-System f\u00fcr Bioinformatik – Wikipedia","description":"before-content-x4 “IDBS” leitet hier weiter. F\u00fcr andere Verwendungen siehe IDB. 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F\u00fcr andere Verwendungen siehe IDB.EIN Workflow-Management-System f\u00fcr Bioinformatik ist eine spezielle Form des Workflow-Management-Systems, das speziell zum Erstellen und Ausf\u00fchren einer Reihe von Rechen- oder Datenmanipulationsschritten oder eines Workflows im Zusammenhang mit der Bioinformatik entwickelt wurde. Derzeit gibt es viele verschiedene Workflow-Systeme. Einige wurden allgemeiner als wissenschaftliche Workflow-Systeme f\u00fcr Wissenschaftler aus vielen verschiedenen Disziplinen wie Astronomie und Geowissenschaften entwickelt. Alle diese Systeme basieren auf einer abstrakten Darstellung des Ablaufs einer Berechnung in Form eines gerichteten Graphen, wobei jeder Knoten eine auszuf\u00fchrende Aufgabe darstellt und Kanten entweder Datenfluss- oder Ausf\u00fchrungsabh\u00e4ngigkeiten zwischen verschiedenen Aufgaben darstellen. Jedes System bietet normalerweise ein visuelles Front-End, mit dem der Benutzer komplexe Anwendungen mit wenig oder keiner Programmierkenntnis erstellen und \u00e4ndern kann.[1][2][3]Beispiele[edit]In alphabetischer Reihenfolge umfassen einige Beispiele f\u00fcr Bioinformatik-Workflow-Management-Systeme:Vergleiche zwischen Workflow-Systemen[edit]Mit einer gro\u00dfen Anzahl von Bioinformatik-Workflow-Systemen zur Auswahl,[13] Es wird schwierig, die Funktionen der verschiedenen Workflow-Systeme zu verstehen und zu vergleichen. Bei der Bewertung und dem Vergleich der Systeme aus Sicht eines Bioinformatikers wurde wenig Arbeit geleistet, insbesondere beim Vergleich der Datentypen, mit denen sie umgehen k\u00f6nnen, der integrierten Funktionen, die dem Benutzer zur Verf\u00fcgung gestellt werden, oder sogar ihrer Leistung oder Benutzerfreundlichkeit. Beispiele f\u00fcr bestehende Vergleiche sind: Das Papier “Wissenschaftliche Workflow-Systeme – kann eine Gr\u00f6\u00dfe f\u00fcr alle passen?”,[3] Dies bietet einen allgemeinen Rahmen f\u00fcr den Vergleich von Workflow-Systemen basierend auf ihren Kontrollfluss- und Datenflusseigenschaften. Zu den verglichenen Systemen geh\u00f6ren Discovery Net, Taverna, Triana, Kepler sowie Yawl und BPEL.Das Papier “Meta-Workflows: Musterbasierte Interoperabilit\u00e4t zwischen Galaxy und Taverna”[14] Dies bietet einen benutzerorientierteren Vergleich zwischen Taverna und Galaxy im Zusammenhang mit der Erm\u00f6glichung der Interoperabilit\u00e4t zwischen beiden Systemen.Das Infrastrukturpapier “Bereitstellung von IKT-Infrastruktur f\u00fcr die biomedizinische Forschung”[15] vergleicht zwei Workflow-Systeme, Anduril und Chipster,[16] in Bezug auf die Infrastrukturanforderungen in einem Cloud-Bereitstellungsmodell.Das Papier “Ein \u00dcberblick \u00fcber bioinformatische Pipeline-Frameworks”[17] Versuche, Workflow-Management-Systeme anhand von drei Dimensionen zu klassifizieren: “Verwenden einer impliziten oder expliziten Syntax, Verwenden eines Konfigurations-, Konventions- oder klassenbasierten Entwurfsparadigmas und Anbieten einer Befehlszeilen- oder Workbench-Schnittstelle”.Verweise[edit]^ Oinn, T.; Greenwood, M.; Addis, M.; Alpdemir, MN; Ferris, J.; Glover, K.; Goble, C.; Goderis, A.; Hull, D.; Marvin, D.; Li, P.; Lord, P.; Pocock, MR; Senger, M.; Stevens, R.; Wipat, A.; Wroe, C. 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