enagybakeriphage phix174 – ウィキペディア

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のウイルス粒子のスキーム描画 Sinheimer Virus

Enterobakteriophage phix174 公式に Escherichia Virus Phix174 、時代遅れ Enterobacteria Phage Phix174 、ドイツ語は、短いφx174のバクテリオファージPhi x 174またはcoliphaageφx174も、一本鎖DNAウイルス（SSDNA）陽性極性であり、種の細菌は 大腸菌 感染した。これは、ウイルス属のウイルスの分類学（ICTV）の公式に認識されている種類に関する国際委員会から唯一のものです Sinheimer Virus （時代遅れ phix174microvirus 、 また bakteriophage phix174 夏を意味します またはφx174グループと呼ばれる）、しかし、他の提案があります（ ファージMED1 ）。 [2]

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φx174のゲノムは、完全に配列決定された最初のDNAベースのゲノムであり、この作業は1977年にフレッドサンガーと彼のチームによって完了しました。 [3] Walter FiersとRobert Sinsheimerは、1962年にすでにφx174-DNAがリングで閉じられていることを実証していました。 [4] Nobel Raureate Arthur Kornbergは、φx174のφx174で初めて、洗浄酵素を介して合成されたDNAが合成生物学の年齢を開始した自然ウイルスのすべての特性を生成できることを証明していました。 [5] [6] 1972年から1974年にかけて、Jerard Hurwitz、Sue Wickner、およびReed Wicknerは、従業員とともに、ウイルスの単一の形の形態の変換を二重伸縮型のレプリケート形式に触媒する酵素を製造するために必要な遺伝子を特定しました。 [7]

2003年、Craig Venterのグループは、彼らが最初に行うことはウイルスゲノムであると報告しました – φx174のそれ – 試験管内で 合成されたオリゴヌクレオチドから。 [8] φx174のウイルス粒子（ビリオン）も 試験管内で 正常に構成されています。 [9] 最近、強く重複するゲノムを完全に減圧することができ、それでも機能的なままであることが示されました。 [十]

バクテリオファージのゲノムは、11の遺伝子を含む [11]

φx174には、円形の単一属DNA（SSDNA）陽性極性があります。ゲノムは、11のタンパク質をコードする5386ヌクレオチドで構成されています。 [11] これらの11遺伝子のうち、ウイルス形態形成に不可欠なのは8つだけです。 GC含有量は44％で、ヌクレオチドの95％はコーディング遺伝子に属します。

感染は、Gタンパク質が細菌宿主細胞の表面にリポ多糖類に結合するときに始まります。 DNAパイロットタンパク質として、Hタンパク質は、コリンの細菌膜（Jazwinski etal。1975）を介してウイルスゲノムを制御します（Tusnády、Simon 2001）。 [12番目] しかし、Hタンパク質は多機能タンパク質であることが示されています（Cherwa、Young、Fane 2011）。 [13] 結晶構造では利用できないφx174の唯一のキャップサイドタンパク質です。芳香族アミノ酸の含有量が少なく、糖分上の含有量が高いため、タンパク質構造が非常に柔軟になります。さらに、Hタンパク質は、おそらく細菌の壁に穴を開けることにより、おそらく高濃度で細菌宿主の溶解（破壊）を誘導します（つまり、ウイルスの伝播段階の終わり）。さらに、ルーボイアン等等。 2009年は、他のウイルスタンパク質の最適な合成にHタンパク質が必要であることがわかりました。タンパク質B（内部足場タンパク質）が余剰に添加されている場合、Hタンパク質の変異を防ぐウイルスオプションは克服できます。 [14]

φx174は、他の生物と比較してゲノムサイズが比較的低いため、DNAシーケンスの陽性対照として定期的に使用されています。 H. 45％ G+C と55％ a+t 。 [11]

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  • P. D. Baas、G。P。Van Heusden、J。M。Vereijken、P。J。Weisbeek、H。S。Jansz： 制限酵素によるバクテリオファージPhix174 RF DNAの切断マップ 。の： 核酸res。 、3（8）、1976年8月、S。1947–1960、 PMC 343051 （無料の全文）、 PMID 1085927
  1. ↑ a b c d そうです ICTV： ICTV分類履歴： Escherichia Virus Phix174 、EC 51、ベルリン、ドイツ、2019年7月。 2020年3月3月（MSL＃35）の電子メール批准
  2. ↑ サイモン・J・ラブリー、マリー・エーヴ・デュプイス、デニス・M・トレンブレイ、ピア・ルック・プラント、ジャック・コルベイル、シルヴァン・モイノー： 大腸菌によって駆動されたバイオテクノロジープロセスの失敗から分離された新しい微小虫科ファージ （PDF）In：Journals ASM：Applied and Environmental Microbiology（AEM）Band 80 Nr。 22、2014年11月、S。6992–7000
  3. ↑ F.サンガー、G。M。エア、B。G。バレル、N。L。ブラウン、A。R。コールソン、J。C。フィデス、C。A。ハチソン、P。M。スロコンベ、M。スミス： バクテリオファージφx174DNAのヌクレオチド配列 。の： 自然 。 265年、 いいえ。 5596 、1977年、 S. 687–695 、doi： 10.1038/265687A0 、 PMID 870828 、bibcode： 1977nature.265..687s 。
  4. ↑ ウォルター・フォート、ロバート・L・焼結： バクテリオファージφx174のDNAの構造 。の： Journal of Molecular Biology 。 5年目、 いいえ。 4 、1962年、 S. 424 、doi： 10.1016/s0022-2836（62）80031-x 。
  5. ↑ アーサー・コーンバーグの論文。 「試験管に生命を作る」 、In：科学における国立医学図書館プロファイル、 1959-1970
  6. ↑ Mehran Goulian、Arthur Kornberg、Robert L. Sinsheimer： DNAの酵素合成、xxiv。感染性ファージφx174DNAの合成 。の： 国立科学アカデミーの議事録 。 58年、 いいえ。 6 、1967年、 S. 2321–2328 、doi： 10.1073/pnas.58.6.2321 、 PMID 4873588 、 PMC 223838 （無料の全文）、bibcode： 1967pnas … 58.2321g 。
  7. ↑ スー・ウィックナー、ジェラード・ハーウィッツ： 精製された大腸菌タンパク質によるX174ウイルスDNAの二本鎖型への変換 、In：Proc Natl Acad Sci USA 71（10）、S。4122–4124、1974年11月、 doi：10.1073/pnas.71.10.4120 、 PMID 4610569 、 PMC 434340 （無料の全文）
  8. ↑ ハミルトンO.スミス、クライドA.ハチソン、シンシアプファンコッホ、J。クレイグベンター： 全ゲノムアセンブリによる合成ゲノムの生成：合成オリゴヌクレオチドからのバクテリオファージ 。の： 国立科学アカデミーの議事録 。 100年、 いいえ。 26 、2003年、 S. 15440–15445 、doi： 10.1073/pnas.2237126100 、 PMID 14657399 、 PMC 307586 （無料の全文）、bibcode： 2003pnas..10015440s 。
  9. ↑ ジェームズ・E・チワ、リンジー・J・オーガニ、ロバーティン・E・アシュリー、スーザン・L・ハベステイン、ベントレー・A・フェイン： 外部足場タンパク質オリゴマーと初期五量体アセンブリ中間体からのφx174プロカプシドのin vitroアセンブリ 。の： Journal of Molecular Biology 。 412年、 いいえ。 3 、2011年、 S. 387–396 、doi： 10.1016/j.jmb.2011.07.070 、 PMID 21840317 。
  10. ↑ ポール・R・ジャシュケ、エリカ・K・リーバーマン、ジョン・ロドリゲス、シリアン・シエラ、デレウ・エイ： 完全に減圧された合成バクテリオファージφx174ゲノムが組み立てられ、酵母でアーカイブされます 。の： ウイルス学 。 434年目、 いいえ。 2 、2012、 S. 278–84 、doi： 10.1016/j.virol.2012.09.020 、 PMID 23079106 。
  11. ↑ a b c Coliphage Phi-X174、完全なGenomencbi参照シーケンス：NC_001422.1 、 NCBI
  12. ↑ G. Tusnády、I。サイモン： HMMTOP Transmembraneトポロジー予測サーバー 。の： バイオインフォマティクス 、17（9）、2001年9月、S。849–850、 PMID 11590105
  13. ↑ J. E. Cherwa Jr、L。N。Young、B。A。Fane： 多機能タンパク質の機能を分離：粒子形態形成に影響するDNAパイロットタンパク質変異体の分離 。の： ウイルス学 、411（1）、2011年3月1日（2011年1月11日）、9〜14ページ、 doi：10.1016/j.virol。2010.12.026 、 PMID 21227478
  14. ↑ Parcent。RubAnrazar、意味のあるチェーン、Ma Onws、Simmonはそれです。 N末端欠失DNAパイロットタンパク質の発現は、φx174複製の初期段階を阻害します 。の： J Virol。 、83（19）、2009年10月、S。9952–9956、 doi：10.1128 / jvi.01077-09 、 PMC 2748053 （無料の全文）、 PMID 19640994

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